由于基因检测技术的进步，专家现在可以分析数百个基因，而过去只能分析几个基因，这使得专家可以更快、更有效地为每个癌症患者制定正确的治疗方法。
2024年3月28日，David Bartlett博士接受《Targeted Oncology》杂志采访，讨论了基因检测在癌症治疗中的应用及其日益增长的重要性。
美国宾夕法尼亚州匹兹堡市阿勒格尼健康网络 (AHN) 癌症研究所主席，国际公认癌症外科医生，腹部癌症治疗先驱，美国肿瘤外科学会前任主席。
David Bartlett博士表示，基因检测使临床医生能够针对肿瘤内的特定突变进行靶向治疗，从而增加了治疗的有效性并改善了患者的预后。此外，他重点提到了液体活检这一新兴技术，它可以分析血液中的循环肿瘤DNA（ctDNA），从而避免了侵入性的组织活检。
基因检测在癌症治疗领域的应用已掀起一场革命性的变革，其中NGS技术更是这一变革中的佼佼者。基因检测在各类癌症中发挥着越来越重要的作用，特别是在肺癌领域，它已经成为指导治疗决策的关键工具。不仅如此，在多种其他癌症的治疗中，基因检测也常被用来辅助临床诊疗，为医生提供更精准的诊疗依据。
在过去的20年里，肺癌患者生物标志物检测从无到有，临床意义不断扩大，已成为常规肿瘤治疗的重要一环。从“一刀切”式的化疗到高度定制化精准治疗方案，是基因检测及相关见解推动了这一变革。首先是认识到一些癌症存在导致蛋白激酶信号传导失控的改变。随后，一个革命性的概念横空出世，即利用小分子酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 靶向酪氨酸激酶，阻止肿瘤细胞的生长和增殖。最后，通过伴随基因检测实现精准治疗，进而显著提升患者生存获益。
1. 基因检测对癌症患者有哪些好处？
David Bartlett：“基因检测基本上可检测到癌症中存在的所有突变。我们通过对癌症患者进行组织或液体活检并实施基因测序，可确定与该癌症相关的突变，这对使用针对这些特定突变的靶向药物非常重要。虽然并非每种癌症都有靶向药物，但随着时间的推移，越来越多的癌症已开发出针对特定突变的靶向药物。预先了解这些突变信息非常重要。此外，基因检测可以帮助我们判断患者是否有遗传因素，对于有遗传因素的，我们可以给予家庭人员进行相关的筛查，实现早发现早治疗。”
2. 基因检测方法发生了哪些变化？
David Bartlett：“多年来，我们对肿瘤基因组学以及肿瘤中存在的突变的认知不断加深，呈现爆发式增长。以前，我们会在肿瘤中寻找2-3个突变，但现在我们已经能够定期筛查500多个基因，以寻找专门影响癌症的已知突变。我们评估的遗传物质数量、突变数量以及检测效率都得到了提升。最初的人类基因组计划需要13年才能完成一个基因组测序（一代），现在我们使用NGS测序一天就能完成，因此，我们分析这些突变的能力随时间的推移在不断提高。”
NGS，即二代测序，又称高通量测序技术，能够同时对多个DNA片段进行测序，从而快速、准确地获取大量的基因组信息。这一技术不仅可以分析单个基因的序列，还能够检测整个基因组的变异情况，因此具有高通量、高效率的优势。在癌症领域，NGS技术为临床医生提供了前所未有的手段，使我们能够更深入地了解肿瘤细胞的遗传特征，从而为精准治疗提供了基础。
3. 基因检测的最新进展是什么？
David Bartlett：“基因检测帮助我们在识别靶向治疗以及攻击特定目标的小分子药物方面取得巨大进展。目前，已有超过100种靶向药物获批用于治疗癌症中的特定突变。第一个被批准用于特定突变的靶向药物是甲磺酸伊马替尼（格列卫），那是在2001年，自此以后靶向药物研发呈现爆发式增长。
TKI治疗方案第一次临床应用是将ABL抑制剂伊马替尼用于治疗慢性髓系白血病 （CML）患者。慢性髓系白血病是一种基因组相对同质的肿瘤，由BCR-ABL1融合引发。第一次靶向治疗取得巨大成功，许多患者的症状迅速得到缓解，在药物毒性降至最低的同时获得了持久疗效（甚至可能治愈）。自此，人们开始寻找其它具有激酶依赖性的肿瘤病例，以及专门干扰这些关键激酶信号通路的治疗方案，引爆了靶向药物的研发。
另一项基因检测的进展是ctDNA检测分析能力。我们知道肿瘤会释放DNA到血液中，通过血液ctDNA检测我们可以识别出肿瘤突变。这是一个巨大的优势，无创、便捷，而且能克服肿瘤异质性。目前，这项技术还在不断发展，我们仍需了解更多关于液体活检是否能准确反映肿瘤活检的情况，我相信液体活检将在未来占据主导地位，并更好地反映肿瘤的状况。”
4. 基因检测最常用于哪些癌症？
David Bartlett：“任何转移性实体肿瘤和血液肿瘤都应该在诊断时进行全面的基因组分析，以便我们寻找所有可能进行靶向治疗的靶向突变，以及随着新药上市而进行临床试验的可能性。目前，基因检测最常用于肺癌和消化道等肿瘤，它可以帮助医生确定患者是否会对靶向或免疫治疗产生反应。对于部分患者来说，免疫治疗可能会改善患者的生存结局，因此，我们要预先知道患者是否有资格接受免疫治疗，这对他们来说可能是变革性的。”
5. NGS是否是基因检测的主要工具？
David Bartlett：“目前，NGS确实是基因检测的主要工具。我们现在是使用NGS进行肿瘤测序的。因为它能一次性检测几十甚至上百个基因，筛查全部用药的可能性，具有通量大、精准度高、信息量丰富的优点，可以在短时间对基因组进行全面的分析，包括TMB和MSI等。”
6. NGS的使用和临床应用有什么策略？
David Bartlett：“我认为，目前的关键策略仍然是围绕我们所需要的靶向基因突变进行分析。例如，针对不同的肿瘤类型，我们是考虑定制开发特定的肿瘤panel？还是使用包含所有突变类型的NGS大panel？这很大程度上取决于成本、费用、保险报销以及一些复杂因素。但我们期望发生的是，每个罹患转移性实体肿瘤（及血液肿瘤）的患者都可以进行NGS检测，以确定与癌症相关的所有已知肿瘤突变。这样，我们就拥有了每位接受治疗的患者全面基因组信息，方便制定当前治疗决策，以及后续进展时，使用新药、新临床试验，以及现有的免疫疗法或其他治疗方法。”
7. 基因检测领域还有哪些挑战和机遇？
David Bartlett：“早筛，我们感兴趣的是如何利用这些突变来诊断和筛查癌症，特别是当我们谈论液体活检时。因此，利用某种形式的NGS方法进行肿瘤诊断和筛查，无疑是该领域一个令人振奋的焦点。我们知道，肿瘤，甚至是早期肿瘤，会源源不断将DNA释放到血液循环系统中，如果我们可以利用这一点作为癌症筛查方法，通过NGS检测识别癌症特有突变，那么我们不仅可以确定患者体内是否存在癌症，还可以确定具体是哪种癌症，从而指导进一步的检查。我认为，最令人兴奋的是，我们可以利用这些技术来进行癌症早筛，或检测和随访接受癌症治疗的患者，以了解他们是否对治疗有反应。”
8. 该领域还有其他正在进行的研究吗？
David Bartlett：“有很多令人兴奋的研究都在进行中，比如，如何提高ctDNA的检测灵敏度及如何利用DNA甲基化、片段化等多组学检测，以进行癌症早筛和分子残留病灶（MRD）检测。我认为在不久的将来会有大量令人兴奋的研究，从生物标志物的角度为我们提供更多的癌症研究指导。”
综合而言，基因检测尤其是NGS技术的出现，已经彻底改变了癌症治疗的面貌。它使我们能够更深入地了解肿瘤细胞的遗传特征，为精准治疗提供了可能。我们相信，但随着技术的不断进步和临床经验的不断积累，基因检测将在未来为癌症患者和健康人群带来更为全面、精准和个性化的医疗服务。
